基于DNA甲基化組學(xué)技術(shù)分析TET1基因?qū)π∈髐NK細(xì)胞DNA甲基化的影響
摘 要:
本研究旨在探究去甲基化酶1(ten eleven translocation, TET 1)對(duì)小鼠子宮內(nèi)自然殺傷細(xì)胞(uterine natural killer, uNK)DNA甲基化的影響,深入了解其分子調(diào)控機(jī)制。無菌采集妊娠10 d小鼠子宮蛻膜,分離純化uNK細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng),利用RNA干擾技術(shù)敲低TET 1基因的表達(dá),提取TET 1干擾組和正常對(duì)照組細(xì)胞的總DNA,利用簡(jiǎn)化基因組DNA甲基化測(cè)序(reduced representation bisulfite sequencing, RRBS)技術(shù)進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果經(jīng)生物信息學(xué)軟件分析進(jìn)行兩組樣本差異甲基化區(qū)域(differentially methylated region, DMR)的統(tǒng)計(jì)與注釋,并進(jìn)一步對(duì)DMR相關(guān)基因進(jìn)行GO數(shù)據(jù)庫分析及注釋,了解相關(guān)基因的功能,利用KEGG數(shù)據(jù)庫對(duì)其調(diào)控的信號(hào)通路進(jìn)行富集分析。(剩余22832字)
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