不同芯片密度對(duì)華西牛重要經(jīng)濟(jì)性狀基因組評(píng)估準(zhǔn)確性的影響

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摘 要：

旨在基于Illumina BovineHD 770K與Cattle 110K芯片在華西牛中的實(shí)際應(yīng)用情況，系統(tǒng)比較在不同標(biāo)記密度下基因組選擇預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性的差異，探索兩款芯片在華西牛遺傳評(píng)估中結(jié)合使用方法。本試驗(yàn)以課題組前期構(gòu)建的華西?；蚪M選擇參考群體為研究對(duì)象，利用重測(cè)序數(shù)據(jù)將3 948頭華西牛770K芯片填充至790K后，分別取90K（兩款芯片交集）、110K、770K、790K（兩款芯片并集）4種標(biāo)記密度，對(duì)華西牛遺傳評(píng)估所涉及的5個(gè)性狀（斷奶重、育肥期平均日增重、產(chǎn)犢難易度、胴體重、屠宰率）進(jìn)行遺傳力估計(jì)，并通過(guò)GBLUP模型利用五折交叉驗(yàn)證對(duì)基因組評(píng)估準(zhǔn)確性進(jìn)行比較，篩選并確定華西牛遺傳評(píng)估中最適標(biāo)記密度。（剩余23010字）