基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接探討穿心蓮改善心肌缺血再灌注損傷的潛在作用機(jī)制
摘要目的:運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接技術(shù)探討穿心蓮改善心肌缺血再灌注損傷(MIRI)的潛在作用靶點(diǎn)及機(jī)制。方法:應(yīng)用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP)篩選出穿心蓮的有效成分和作用靶點(diǎn),采用UniPort數(shù)據(jù)庫注釋靶點(diǎn)基因;利用人類基因數(shù)據(jù)庫(GeneCards)、DisGeNET、治療靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(TTD)、在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(OMIM)獲得MIRI的靶點(diǎn);運(yùn)用Venn在線軟件獲取穿心蓮與MIRI的共同靶點(diǎn)基因,并以Venn圖展示;采用CytosCape3.9.1軟件構(gòu)建“藥物-藥物有效成分-靶點(diǎn)”可視化網(wǎng)絡(luò)圖;應(yīng)用注釋、可視化和綜合發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫(DAVID)對交集靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體(GO)及京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析;通過STRING數(shù)據(jù)庫將交集靶點(diǎn)進(jìn)行蛋白-蛋白相互作用(PPI)分析,利用Cytoscape3.9.1軟件Cytohubba插件對PPI網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析,獲取關(guān)鍵靶點(diǎn)。(剩余24242字)
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- 中西醫(yī)結(jié)合心腦血管病雜志
- 2025年13期
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