蓖麻bZIP基因家族的全基因組鑒定、生物信息學及表達分析

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摘要  為了解蓖麻bZIP基因家族成員的組成和家族進化關系及特征，本研究利用生物信息學鑒定家族成員，進行基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)保守基序分析及系統(tǒng)發(fā)育分析，同時分析其蛋白的理化性質(zhì)、磷酸化位點和互作關系，以及該基因在組織中的表達模式和表達量。結(jié)果表明，共鑒定出46個蓖麻bZIP基因家族成員，位于10個染色體上；基因結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)保守基序較為復雜，可分為11個亞族，包含25個基序；與擬南芥進化相似，較為保守；bZIP蛋白為親水性蛋白，位于細胞核、細胞膜和葉綠體，主要通過絲氨酸的磷酸化來發(fā)揮生物學作用，蛋白RcbZIP18、RcbZIP27、RcbZIP2、RcbZIP17和RcbZIP46之間的聯(lián)系較多，通過蛋白間的相互作用參與蓖麻各個生長時期；該基因家族均參與葉、莖、根和胚等生長時期的發(fā)育調(diào)控，其中RcbZIP10、RcbZIP25和RcbZIP44在葉片和種子中表現(xiàn)出明顯的組織差異性。（剩余12270字）