沉默DDX39A 基因?qū)κ彻馨㏕E-1 細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的作用及其機(jī)制
[摘 要] 目的:探討沉默 DEAD-box RNA解旋酶 39A (DDX39A) 對食管癌 TE-1細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的調(diào)控作用,并闡明其可能的作用機(jī)制。方法:通過基因表達(dá)匯編 (GEO) 數(shù)據(jù)庫下載GSE63941、GSE77861、GSE20347 和GSE16153 芯片數(shù)據(jù),利用癌癥基因組圖譜(TCGA) 數(shù)據(jù)庫篩選并下載食管癌相關(guān)數(shù)據(jù);采用R 軟件分析差異表達(dá)基因;通過基因與蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系檢索工具(STRING) 構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用(PPI) 網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù),并采用Cytoscape 軟件中MCODE 插件整合數(shù)據(jù),鑒別出相關(guān)性強(qiáng)的關(guān)鍵基因,用基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)動態(tài)分析網(wǎng)頁工具(GEPIA 2) 分析正常食管黏膜和食管癌組織中關(guān)鍵基因的表達(dá)情況,用卡普蘭-邁爾曲線圖(Kaplan-Meier Plotter) 將篩查出來的關(guān)鍵基因進(jìn)行生存分析并繪圖。(剩余13900字)
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- 吉林大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版)
- 2025年01期
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