甜瓜GRAS家族全基因組的鑒定與表達分析

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摘要：為了研究甜瓜（Cucumis melo L.）GRAS基因家族的結構特征、進化模式和生長發(fā)育過程中的表達模式，對甜瓜GRAS全基因組的基本信息、染色體位置、共線性、系統(tǒng)發(fā)育樹、基因結構、表達模式、順式元件進行了全面分析。結果表明，從甜瓜中鑒定出37個GRAS基因；這些基因在甜瓜的11條染色體上呈不均勻分布，并在6、7、8號染色體上出現(xiàn)串聯(lián)重復；甜瓜GRAS家族可分為HAM、LS、SCR、SCL3、DELLA、LISCL、SHR、PAT1 8個亞族；基因結構分析顯示，含有1～3個內含子的基因有8個，沒有內含子的基因有29個；啟動子分析，鑒定到生長素、脫落酸、赤霉素、低溫、干旱、光信號響應作用元件以及參與分生組織和胚乳表達的元件；表達模式分析結果表明，HAM、DELLA亞族的基因幾乎在所有組織中都有表達，LS亞族在根和莖中表達含量較高，PAT1亞族在甜瓜的整個生長發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用。（剩余10823字）