多刺綠絨蒿WD40基因家族的鑒定及生物信息學(xué)分析

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摘要：  WD40轉(zhuǎn)錄因子家族廣泛參與調(diào)節(jié)植物生長(zhǎng)、發(fā)育、次生代謝物積累和環(huán)境適應(yīng)等過(guò)程。為了探究WD40家族在多刺綠絨蒿生長(zhǎng)、發(fā)育和次生代謝物積累以及抗逆方面的作用，該研究基于全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)，鑒定了多刺綠絨蒿WD40基因家族成員，并對(duì)這些基因及其編碼的蛋白進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明：（1）共鑒定到19個(gè)WD40基因，編碼的蛋白均具有WD40結(jié)構(gòu)域，氨基酸數(shù)目為109～758 aa，分子量介于11 830～84 130 Da之間，預(yù)測(cè)大多數(shù)蛋白定位在細(xì)胞核中且都為親水性蛋白;（2）系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明多刺綠絨蒿與罌粟、博落回親緣關(guān)系較近;（3）WD40基因啟動(dòng)子區(qū)域均存在數(shù)量不等的激素或逆境響應(yīng)元件，表明該家族基因可能參與植物生長(zhǎng)、發(fā)育和次生代謝物積累等多種生物學(xué)進(jìn)程的調(diào)節(jié);（4）蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)顯示這些蛋白在進(jìn)化過(guò)程中發(fā)生了不同程度的進(jìn)化。（剩余17667字）