基于甲基化捕獲聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序探討梔子-川芎藥對(duì)抗動(dòng)脈粥樣硬化的作用機(jī)制

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摘要目的：觀察梔子-川芎藥對(duì)對(duì)氧化型低密度脂蛋白（ox-LDL）誘導(dǎo)的RAW264.7泡沫細(xì)胞DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄組表達(dá)的作用。方法：細(xì)胞毒性試驗(yàn)（CCK-8）法檢測(cè)不同濃度梔子-川芎凍干粉對(duì)RAW 264.7細(xì)胞的增殖抑制情況；以ox-LDL處理RAW 264.7細(xì)胞48 h形成泡沫細(xì)胞，將細(xì)胞分為梔子-川芎凍干粉組（80 mg/L ox-LDL、0.3 g/L 梔子-川芎凍干粉干預(yù)）、模型組（80 mg/L ox-LDL處理）和空白對(duì)照組（未處理）；氣相、色譜質(zhì)譜法（GC-MS）和酶聯(lián)免疫吸附法（ELISA）分別檢測(cè)各組總膽固醇（TC）、游離膽固醇（FC）以及炎性因子［腫瘤壞死因子α（TNF-α）、白介素6（IL-6）和細(xì)胞間黏附分子1（ICAM-1）］的表達(dá)；采用DNA甲基化捕獲測(cè)序（MC-seq）和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（RNA-seq）方法檢測(cè)各組細(xì)胞全基因組DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)水平，使用DSS工具分析各組樣本間的差異甲基化位點(diǎn)（DMS）和差異表達(dá)基因（DEGs），并利用生物信息學(xué)方法對(duì)差異基因進(jìn)行京都基因與基因組百科全書（KEGG）和基因本體（GO）富集分析。（剩余15411字）