復合侵染云南西番蓮的兩種菜豆金色花葉病毒屬病毒的分子鑒定及序列分析
摘要西番蓮Passiflora caerulea是我國南部省區(qū)廣泛種植的一種熱帶果樹。本研究于2020年6月從云南省德宏州西番蓮種植區(qū)采集到4份疑似感染菜豆金色花葉病毒屬病毒的西番蓮樣品,利用PCR擴增、克隆、測序以及生物信息學分析等方法,明確了西番蓮樣品受菜豆金色花葉病毒屬病毒侵染。對4份西番蓮樣品進行菜豆金色花葉病毒屬病毒全基因組擴增,從中共獲得5條菜豆金色花葉病毒屬病毒全基因組序列,分別命名為YN7292-6、YN7293-12、YN7293-4、YN7294-16和YN7295-25,均具有菜豆金色花葉病毒屬單組分病毒的典型結構,編碼7個開放閱讀框(open reading frame, ORF);其中YN7292-6、YN7293-12、YN7294-16及YN7295-25與一品紅曲葉病毒(Euphorbia leaf curl virus, EuLCuV)的不同分離物的核苷酸相似性均高于99.05%,為EuLCuV的不同分離物;而YN7293-4則與分離自江西西番蓮樣品的廣東番木瓜曲葉病毒(papaya leaf curl Guangdong virus, PaLCuGdV)分離物GNPF1(GenBank登錄號:MK673114.1)的核苷酸相似性最高,為99.70%,為PaLCuGdV的一個分離物;重組分析發(fā)現(xiàn),2個分離物EuLCuV-YN7293-12和PaLCuGdV-YN7293-4 均為重組病毒。(剩余17821字)
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