基于生物信息學方法雙芯片聯合分析阿爾茨海默病海馬相關差異基因的研究
【摘要】 目的 利用生物信息學篩選阿爾茨海默?。ˋlzheimer’s disease,AD)海馬組織的差異表達基因(DEGs),分析DEGs的生物學功能和信號通路,為AD的診斷、治療靶點的篩選提供參考。方法 利用GEO(gene expression omnibus)數據庫下載基因芯片GSE48350、GSE5281,使用數據庫GEO2R工具在線分析,以P<0.05,|logFC>1|為條件篩選差異基因,篩選出與AD海馬組織相關的DEGs,通過制作維恩圖取交集獲得兩個芯片共同DEGs;使用R語言enrichGO函數對篩選出來的DEGs進行基因本體論(GO)功能富集分析;在Metascape網站做京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析;使用STRING數據庫和Cytoscape3.9.1軟件進行蛋白-蛋白相互作用(PPI)網絡分析。(剩余10874字)
目錄
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