基于GEO和TCGA數(shù)據(jù)庫胰腺癌生存相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析
摘要:目的 基于胰腺癌相關(guān)的高通量基因表達(dá)(GEO)和癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù),采用生存相關(guān)算法篩選并驗(yàn)證參與胰腺癌患者生存的關(guān)鍵預(yù)后基因。方法 采用GEO數(shù)據(jù)庫2個(gè)胰腺癌基因芯片(Microarray)和TCGA數(shù)據(jù)庫胰腺癌轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)數(shù)據(jù),利用Kaplan-Meier(KM)分析和Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型進(jìn)行生存相關(guān)基因的過濾并取目的基因交集;對(duì)交集基因進(jìn)行多因素回歸分析與臨床相關(guān)性分析篩選預(yù)后相關(guān)基因;對(duì)預(yù)后相關(guān)基因進(jìn)行通路富集分析和CIBERSORT免疫富集分析尋找其調(diào)控胰腺癌的潛在分子機(jī)制。(剩余16172字)
試讀結(jié)束
目錄
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