基于COⅠ基因序列的泥鰍、大鱗副泥鰍選育群體雜交子代遺傳多樣性分析
摘 要:為評(píng)估泥鰍、大鱗副泥鰍選育群體的遺傳育種潛力,通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增和一代測(cè)序技術(shù),獲得經(jīng)兩代群體選育的泥鰍自繁(M)、大鱗副泥鰍自繁(P)及其正交(MP)、反交(PM)等4個(gè)子代泥鰍種群的線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ基因COⅠ片段,并分析了其遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示:(1)4種泥鰍的COⅠ基因片段堿基組成相似,均表現(xiàn)為A+T的含量(54.0%~56.2%)高于C+G的含量(43.8%~46.4%);(2)4種泥鰍COⅠ基因片段的682個(gè)位點(diǎn)中,共檢測(cè)到135個(gè)多態(tài)位點(diǎn)(占19.79%),其中128個(gè)為簡(jiǎn)約信息位點(diǎn),7個(gè)為單堿基變異位點(diǎn),變異均為轉(zhuǎn)換或顛換,未發(fā)現(xiàn)堿基的插入與缺失;(3)M、P、MP、PM各定義15個(gè)單倍型,單倍型多態(tài)性均為1.000±0.024,核苷酸多態(tài)性分別為0.020 66±0.006 48、0.025 80±0.002 31、0.029 61±0.005 62和0.022 30±0.001 94,均具有高單倍型多樣性和高核苷酸多態(tài)性;(4)M、P、MP、PM種內(nèi)遺傳距離分別為0~0.020、0~0.024、0~0.027和0~0.023,種間遺傳距離為0.024~0.180,系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果顯示,MP與M親緣關(guān)系更近,PM與P親緣關(guān)系更近,體現(xiàn)出明顯的偏母系遺傳效應(yīng)。(剩余10379字)
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- 水產(chǎn)科技情報(bào)
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